Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcc4E9Q236 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc4E9Q236 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms