Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NebE9Q1W3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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