Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrp3E9Q1T6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms