Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
E430018J23RikE9PZQ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E430018J23RikE9PZQ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms