Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsph10bE9PYQ0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsph10bE9PYQ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms