Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Parp4E9PYK3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp4E9PYK3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms