Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptbn4E9PX29 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptbn4E9PX29 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptbn4E9PX29 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sptbn4E9PX29 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sptbn4E9PX29 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptbn4E9PX29 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sptbn4E9PX29 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms