Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rsf1E9PWW9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rsf1E9PWW9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms