Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FgaE9PV24 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FgaE9PV24 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FgaE9PV24 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms