Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl3E0CZ16 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl3E0CZ16 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms