Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb3D3Z6J4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms