Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx6-2D3Z4R4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms