Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930467E23RikD3Z1P8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930467E23RikD3Z1P8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms