Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200bD3Z0P8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms