Protein–RNA interactions for Protein: D3YX03

Gm7849, Predicted gene 7849, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7849D3YX03 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm7849D3YX03 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm7849D3YX03 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms