Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim30cD3YVI9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim30cD3YVI9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms