Protein–RNA interactions for Protein: B9UIU9

Gm17660, Predicted gene, 17660, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17660B9UIU9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17660B9UIU9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17660B9UIU9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms