Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r180B9EK86 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r180B9EK86 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms