Protein–RNA interactions for Protein: B9EJR8

Dnaaf5, Dynein assembly factor 5, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf5B9EJR8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnaaf5B9EJR8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaaf5B9EJR8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaaf5B9EJR8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms