Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cttnbp2B9EJA2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cttnbp2B9EJA2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cttnbp2B9EJA2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cttnbp2B9EJA2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms