Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfia4B8QI36 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppfia4B8QI36 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfia4B8QI36 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms