Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Phf11bB4XVQ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf11bB4XVQ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf11bB4XVQ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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