Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cspp1B2RX88 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cspp1B2RX88 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cspp1B2RX88 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms