Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rd3lB2RV38 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rd3lB2RV38 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms