Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf518aB2RRF6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Znf518aB2RRF6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Znf518aB2RRF6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Znf518aB2RRF6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Znf518aB2RRF6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms