Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms