Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp8b5A3FIN4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp8b5A3FIN4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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