Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Palm3A2TJV2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palm3A2TJV2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palm3A2TJV2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palm3A2TJV2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palm3A2TJV2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Palm3A2TJV2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms