Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms