Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramef17A2ASJ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef17A2ASJ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef17A2ASJ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms