Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn3aA2ASI5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn3aA2ASI5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn3aA2ASI5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms