Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34dA2AGU5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34dA2AGU5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms