Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl2A2AGA4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl2A2AGA4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms