Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm884A2A9H6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm884A2A9H6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms