Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prdm16A2A935 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm16A2A935 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prdm16A2A935 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prdm16A2A935 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.1 ms