Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd5A2A8L1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms