Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Prdm2A2A7B5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prdm2A2A7B5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm2A2A7B5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm2A2A7B5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms