Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calcoco2A2A6M5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms