Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm6268A2A3U9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm6268A2A3U9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm6268A2A3U9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms