Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms