Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp2lA0A0M3U1B0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms