Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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