Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Tmem89-202ENSMUST00000192852 945 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Rpl14-ps1-201ENSMUST00000026901 653 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-203ENSMUST00000050905 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gtf2f2-201ENSMUST00000088922 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Col5a3Q9JLI2 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm5459-201ENSMUST00000171235 798 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm17868-201ENSMUST00000192761 668 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm18780-201ENSMUST00000209594 574 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Rpl6-201ENSMUST00000031617 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mif-201ENSMUST00000038169 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Sept2-215ENSMUST00000179353 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Etfbkmt-204ENSMUST00000111551 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Asb5-201ENSMUST00000033918 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Etfbkmt-201ENSMUST00000047531 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Col5a3Q9JLI2 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Col5a3Q9JLI2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Col5a3Q9JLI2 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Col5a3Q9JLI2 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Col5a3Q9JLI2 Gm8982-201ENSMUST00000184198 1295 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Etv3l-201ENSMUST00000193196 325 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 CT030664.1-201ENSMUST00000223639 908 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Apom-201ENSMUST00000025249 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Snap25-201ENSMUST00000028727 2116 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Zfp410-208ENSMUST00000222258 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Cox4i2-202ENSMUST00000109821 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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