Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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