Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Padi3-202ENSMUST00000172098 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms