Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoa5Q8C7G5 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms