Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cwc22Q8C5N3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms