Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Atg16l1Q8C0J2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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