Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Htatsf1Q8BGC0 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Htatsf1Q8BGC0 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Htatsf1Q8BGC0 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Htatsf1Q8BGC0 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Htatsf1Q8BGC0 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Htatsf1Q8BGC0 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Htatsf1Q8BGC0 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Htatsf1Q8BGC0 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Htatsf1Q8BGC0 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Htatsf1Q8BGC0 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Htatsf1Q8BGC0 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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