Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BcanQ61361 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms